棉花遺傳育種產業服務

棉花是我國重要的農作物之一,棉纖維與人們的日常生活息息相關。通過利用全基因組的基因分型芯片,如kps棉花80K芯片等,可以解析棉纖維產量及品質的遺傳機制,為棉花的遺傳育種產業服務提供良好的指導。

棉花分子育種平臺

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Technological process

技術流程    

  • Illumina?平臺原理與實驗流程

    對基因組DNA進行定量;

    非PCR擴增;

    片段化gDNA、沉淀與重懸??;

    雜交:DNA片段變性后,與芯片上特異的50 mer寡核苷酸探針形成退火,一種微珠類型對應一個SNP位點;

    延伸與染色:洗去未雜交和非特異雜交的DNA之后,在芯片上進行單堿基延伸,單堿基添加了特異的熒光基團,從而可區分樣本的SNP基因型。

  • AxiomTM平臺原理與實驗流程

    DNA定量后進行DNA擴增;

    片段化gDNA、沉淀與重懸;

    變性與雜交:DNA片段變性后與芯片上的特異的30 mer寡核苷酸探針形成退火,一種類型對應一個SNP位點;

    延伸、連接與染色:洗去未雜交和非特異性雜交的DNA之后,帶有特定熒光基團的檢測探針與正確堿基配對后連接,從而區分SNP的基因型。

Sample requirements

樣本要求    

  •                    

    DNA樣品

     總量:

    ≥ 1.0μg

     濃度:

    ≥ 50ng/μL

  •                    

    組織樣本

     總量:

    ≥ 100mg

  •                    

    血液樣本

     總量:

    ≥ 2mL